Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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