Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms