Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms