Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cers3Q1A3B0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cers3Q1A3B0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cers3Q1A3B0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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