Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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