Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col19a1Q0VF58 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms