Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms