Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisal1Q0VBP7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms