Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms