Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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