Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms