Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms