Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F13bQ07968 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms