Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MestQ07646 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MestQ07646 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MestQ07646 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms