Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms