Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms