Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms