Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms