Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms