Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms