Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms