Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms