Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms