Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms