Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb5Q02739 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms