Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GscQ02591 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GscQ02591 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms