Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms