Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms