Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms