Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms