Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms