Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms