Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cbx1P83917 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms