Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcgP82348 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcgP82348 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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