Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx2P81066 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms