Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms