Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms