Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms