Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd13P70217 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd13P70217 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd13P70217 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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