Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fbxo40P62932 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms