Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms