Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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