Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdhd1P59328 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdhd1P59328 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms