Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms