Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn18P56857 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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