Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms