Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms