Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CartptP56388 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CartptP56388 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CartptP56388 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CartptP56388 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CartptP56388 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CartptP56388 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CartptP56388 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CartptP56388 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CartptP56388 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CartptP56388 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CartptP56388 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms