Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms