Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtpreP49446 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtpreP49446 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtpreP49446 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtpreP49446 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms